2025
07-27
07-27
三代全长测序和二代转录组测序技术相结合的应用
淹水胁迫对植物的生长发育有负面影响,研究耐涝机制对分子育种的研究具有重要意义。中国农业科学院郑州果树研究所研究团队选取猕猴桃耐涝基因型KR5为研究材料,结合三代SMRT测序和二代测序进行了转录组分析,揭示了猕猴桃的耐涝机制,并在《International Journal of Molecular Sciences》(IF=6.208/化学2区)期刊上发表了题为“Full-Length ...阅读... 阅 读 全 部 >
导读三代测序和de novo组装技术发展得如火如荼,是如今高通量测序最热门的技术。今天为大家分享一篇三代测序和de novo组装在植物方面应用的综述文章,希望帮助更多的科研小伙伴们了解这项技术,并应用到自己的科研工作中。发表期刊:Current Opinion in Plant Biology发表时间:2020.01.22影响因子:7.508...阅读全文>>...
近两三年中,测序平台又有了突破式的革新。虽然Illumina的二代测序平台仍是市场主流,但随着Pacific Biosciences公司商业化的三代测序仪平台成功推出,三代测序已正式应用于各项研究中。与之前的平台相比,三代测序技术无需PCR扩增就可实现对每一条DNA分子的单独测序。由于三代测序读长长、无扩增及GC偏好性,目前广泛应用于动植物de novo测序辅助组装及全长转录组测序。那么三代测序在...
上次小编给大家介绍了,大家看过之后是不是也有一种想发高分文章的冲动?古语云“九层之台,起于累土”,今天小编就给大家重点介绍一下好文章背后的故事------PacBio三代测序的文库制备。首先,我们来认识一下三代测序的文库结构,与二代测序线状的文库结构不同,三代测序的文库是“哑铃型”的环状结构,中间是插入片段,两端分别是茎环结构的接头(图1)。这种“哑铃型”文库是三代文库设计的最大亮点,环状的文.....
转眼间,十月已经到来,十月是一个充满希望的时节,是一个硕果累累的季节。在这么美好的时节里小锐有很多新技术、好消息与大家分享,接下来先向大家隆重介绍三代+二代宏基因组测序分析产品。随着测序技术的不断更新,三代测序技术也越来越成熟,Nanopore测序读长更长,错误率更低,对生物信息相关领域的研究具有重大意义。近年来Nanopore测序的宏基因组高分文章已发表多篇,且已成功应用于微生物宏基因组研究领域...
纳米孔测序是一种由ONT(Oxford Nanopore Technology)研发的单分子测序技术。在转录组测序应用中,相比于传统二代RNA-Seq测序技术,长读长的纳米孔RNA测序可以在无需打断的条件下得到全长序列并进行定量,同时直接RNA测序还可以检测多种碱基修饰,且测序无需扩增,减少了PCR过程引入的碱基偏倚。ONT测序技术在多个方面具有非常强悍的优势,然而,一份合格的下机数据才是科研成功...
随 着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以获得更多的数据量。与之对应的是,还有一些技术的进步使得单条序列的测序读长变得更长——...阅读全文&g...
近年来,微生物群落结构多样性一直是科研工作者研究的热点,微生物“个 头小,本领强”,从人体的皮肤、口腔、胸腔、阴道到肠道、粪便,无处不在,又称为“人体第二基因组”,在人体中发挥着巨大的作用。还广泛存在于土壤、水体、发酵液、植物、空气等环境样本中,它们推动着地球物质循环,影响着人体乃至整个地球生物圈的健康。 传统研究中,是将环境样本中的微生物进行分离培养,提取已经分离培养出来的每一个纯菌的DNA,针...
期刊:Molecular Ecology Resources影响因子:7.093文章题目:Single-molecule long-read sequencing reveals extensive genomic and transcriptomic variation between maize and its wild relative teosinte (Zea mays ssp....阅...
荟萃心理学各领域新进展、新动态来源 | 北京大学心理与认知科学学院官网近日,北京大学IDG麦戈文脑科学研究所、心理与认知科学学院、北大-清华生命科学联合中心、海南大学生物医学工程学院王征实验室,在《Nature Communications》在线发表题为“Brain-wide and cell-specific tranomic insights into MRI-derived cort...阅...